这些药物靶向黑色素瘤细胞的一部分，使其发生与正常细胞不同的变化。靶向药物的作用与标准化学疗法药物不同，后者基本上会攻击任何快速分裂的细胞。靶向药物对治疗具有某些基因变化的黑色素瘤非常有帮助。

靶向BRAF基因突变细胞的药物

所有黑色素瘤患者中约有一半存在BRAF基因突变。具有这些突变的黑色素瘤细胞会产生能够帮助其生长的BRAF蛋白。一些药物靶向此蛋白和他的相关蛋白，例如MEK蛋白。

如果患者的黑素瘤已经扩散到皮肤以外，则可能需要进行活检，以确定癌细胞是否具有BRAF突变。靶向BRAF蛋白（BRAF抑制剂）或MEK蛋白（MEK抑制剂）的药物不太可能在具有正常BRAF基因的黑色素瘤上起作用。

大多数情况下，如果一个人患有BRAF突变并需要靶向治疗，他们将同时给予BRAF抑制剂和MEK抑制剂，因为联合用药通常比单独使用一种药物效果更好。

BRAF抑制剂

维罗非尼（Vemurafenib/威罗菲尼，Zelboraf），达拉菲尼（Dabrafenib，Tafinlar）和康奈非尼（Encorafenib，Braftovi）是直接攻击BRAF蛋白的药物。
这些药物可以缩小或减缓一些黑色素瘤已经扩散或无法完全切除的患者肿瘤的生长。

达拉菲尼也可在III期黑色素瘤患者手术后（与MEK抑制剂曲美替尼一起）使用（见下文），可帮助降低癌症复发的风险。

常见的副作用可能包括：

皮肤增厚、皮疹、瘙痒、对阳光敏感、头痛、发烧、关节痛、疲劳、脱发和恶心。

较不常见但严重的副作用可能包括心律问题、肝脏问题、肾衰竭、严重的过敏反应、严重的皮肤或眼睛问题、出血和血糖水平升高。

一些使用这些药物治疗的人会出现新的鳞状细胞皮肤癌。这些癌症通常没有黑素瘤那么严重，可以通过切除它们来治疗。尽管如此，医生还是会在治疗期间和之后的几个月里经常检查患者的皮肤。如果患者发现皮肤上有任何新的生长或不正常的地方，也应该及时让医生知道。

MEK抑制剂

MEK基因与BRAF基因协同工作，因此阻断MEK蛋白的药物也可以帮助治疗BRAF基因突变的黑色素瘤。MEK抑制剂包括曲美替尼（Trametinib，Mekinist）、考比替尼（Cobimetinib，Cotellic）和比尼替尼（Binimetinib/贝美替尼，Mektovi）。

这些药物可用于治疗已扩散或无法通过手术切除的黑色素瘤。

曲美替尼也可以和达拉菲尼一起用于III期黑色素瘤手术后的患者，从而有助于降低癌症复发的风险。

同样，最常见的方法是将MEK抑制剂与BRAF抑制剂结合使用。与单独使用任何一种药物相比，这似乎可以使肿瘤缩小维持更长的时间。在这种联合用药上某些副作用（例如其他皮肤癌的发展）不太常见。

常见的副作用可能包括：

皮疹、恶心、腹泻、肿胀和对阳光敏感。罕见但严重的副作用可能包括心肺或肝脏损害、出血或血块、视力问题、肌肉损伤、和皮肤感染。

针对具有C-KIT基因突变细胞的药物

一小部分黑色素瘤的C-KIT基因发生了变化，这有助于它们的生长。这些突变在身体某些部位的黑色素瘤中更为常见：

手掌、脚掌或指甲下（称为肢端黑素瘤）
口腔内或其他黏膜区域
长期暴露在阳光下的区域

一些靶向药物，例如伊马替尼（imatinib ，Gleevec/格列卫）和尼洛替尼（nilotinib，Tasigna/达希纳），可能会通过改变C-KIT来影响细胞。患有始于以上这些位置之一的晚期黑色素瘤，如果检测到C-KIT基因突变，这可能意味着这些药物之一可能会有所帮助。